Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB5

C8orf44, Putative uncharacterized protein C8orf44, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf44Q96CB5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C8orf44Q96CB5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C8orf44Q96CB5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms