Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC47Q96A33 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms