Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-234ENST00000532630 549 ntTSL 314.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-207ENST00000525398 1000 ntTSL 314.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARFGAP2-203ENST00000524586 548 ntTSL 414.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RPH3AL-217ENST00000575634 571 ntTSL 414.53□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-214ENST00000541760 562 ntTSL 214.52□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-220ENST00000481020 1704 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APP-210ENST00000448850 1846 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLCD3-211ENST00000618022 495 ntTSL 414.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 IRF2-203ENST00000504340 565 ntTSL 414.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-208ENST00000504294 557 ntTSL 514.45□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GSE1-213ENST00000568080 289 ntTSL 514.45□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EIF2B5-209ENST00000481054 3460 ntTSL 1 (best)14.44□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COQ8A-204ENST00000476488 264 ntTSL 314.44□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-210ENST00000539157 586 ntTSL 514.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-221ENST00000545798 534 ntTSL 414.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 ZNF17-205ENST00000599867 433 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-209ENST00000538227 577 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FAM168A-205ENST00000632101 473 ntTSL 214.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 STK24-205ENST00000444574 1590 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APLP2-211ENST00000529235 537 ntTSL 414.37□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 314.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 STAU2-204ENST00000518767 1146 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 MAD1L1-219ENST00000481633 548 ntTSL 214.22□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ATP5C1-203ENST00000460362 414 ntTSL 314.21□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 54.9
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TBRG4Q969Z0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 USP15-216ENST00000550632 728 ntTSL 314.16□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UBN1-203ENST00000585857 545 ntTSL 414.14□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-213ENST00000449369 825 ntTSL 514.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FAM169A-204ENST00000510609 5908 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.155e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-220ENST00000569187 612 ntTSL 214.11□□□□□ -0.155e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.155e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 514.11□□□□□ -0.159e-8■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BRMS1L-202ENST00000547420 650 ntTSL 314.09□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DLGAP4-208ENST00000478910 2674 ntTSL 214.08□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RNF4-208ENST00000507247 616 ntTSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SNX14-214ENST00000509338 505 ntTSL 314.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-217ENST00000520856 589 ntTSL 314.04□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 54.9
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