Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN3Q969G5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAVIN3Q969G5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms