Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATRIPQ8WXE1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATRIPQ8WXE1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms