Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC9Q8TBE3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FNDC9Q8TBE3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms