Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MSL3Q8N5Y2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSL3Q8N5Y2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms