Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMYD4Q8IYR2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms