Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB8

SUPV3L1, ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPV3L1Q8IYB8 SEC13-206ENST00000397102 582 ntTSL 313.77□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.215e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 DHX38-206ENST00000564622 390 ntTSL 213.4□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SNRNP25-203ENST00000397876 831 ntTSL 313.36□□□□□ -0.275e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 MRPL21-204ENST00000541265 555 ntTSL 413.23□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-13■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SEC13-204ENST00000397099 555 ntTSL 413.13□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.315e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SEC13-211ENST00000431352 832 ntTSL 513□□□□□ -0.335e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.345e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.345e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.355e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 POLR3E-208ENST00000564061 4800 ntTSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SEC13-205ENST00000397101 592 ntTSL 212.82□□□□□ -0.365e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-222ENST00000522752 944 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-228ENST00000524193 685 ntTSL 312.77□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-224ENST00000522955 2268 ntTSL 212.74□□□□□ -0.375e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.395e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-211ENST00000520973 2564 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.45e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.425e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 LARS-213ENST00000511505 1089 ntTSL 512.28□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-223ENST00000522904 1724 ntTSL 512.28□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.455e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-218ENST00000521935 967 ntTSL 212.11□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 CCNL2-209ENST00000471930 846 ntTSL 512.06□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-214ENST00000521528 656 ntTSL 412.04□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 CCNL2-210ENST00000473872 557 ntTSL 212□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SYMPK-218ENST00000602061 503 ntTSL 411.8□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 PPP6R1-202ENST00000586690 668 ntTSL 211.77□□□□□ -0.535e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ELP3-218ENST00000524103 1914 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 VEGFA-216ENST00000512683 475 ntTSL 1 (best)11.66□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SNRNP25-206ENST00000481947 1260 ntTSL 511.42□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ABCF1-205ENST00000475993 2860 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 DHX38-204ENST00000563819 706 ntTSL 311.22□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 211.13□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 510.85□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 410.78□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 STAU2-228ENST00000524191 808 ntTSL 310.68□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 55.7
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SUPV3L1Q8IYB8 SLC38A1-210ENST00000552197 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 OFD1-209ENST00000490265 4259 ntTSL 210.59□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 STAU2-203ENST00000518502 687 ntTSL 310.52□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 55.7
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SUPV3L1Q8IYB8 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 LARS-206ENST00000505223 582 ntTSL 310.42□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 MIR4647-201ENST00000583964 80 ntBASIC10.33□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SLC39A8-204ENST00000502903 570 ntTSL 410.18□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 LARS-208ENST00000506436 539 ntTSL 310.09□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 STAU2-202ENST00000517542 1695 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SPATA5-202ENST00000422835 2492 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 29.83□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 MRPL21-205ENST00000541279 764 ntTSL 59.79□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-229ENST00000524354 476 ntTSL 59.77□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ELP3-204ENST00000518112 2059 ntTSL 29.44□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 FASN-211ENST00000637026 100 ntTSL 59.37□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SLC39A8-207ENST00000512657 558 ntTSL 49.15□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 FASN-213ENST00000637693 100 ntTSL 59.15□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 MRPL21-202ENST00000450904 662 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 LARS-216ENST00000618084 720 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 CCDC47-207ENST00000612558 1586 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.055e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 LARS-203ENST00000503654 534 ntTSL 48.28□□□□□ -1.085e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-226ENST00000523239 519 ntTSL 58.13□□□□□ -1.115e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ELP3-205ENST00000519261 1924 ntTSL 28.03□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 ELP3-216ENST00000523687 1923 ntTSL 28.03□□□□□ -1.125e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.155e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 SNRNP25-205ENST00000466183 1130 ntTSL 27.78□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 USP48-207ENST00000471752 445 ntTSL 37.56□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 PPIL2-208ENST00000484439 863 ntTSL 57.32□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.245e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.265e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 CCDC47-205ENST00000582331 693 ntTSL 36.98□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 55.7
SUPV3L1Q8IYB8 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.335e-6■■■■■ 55.7
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