Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC83Q8IWF9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms