Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms