Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2AFVQ71UI9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFVQ71UI9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms