Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RBM43Q6ZSC3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RBM43Q6ZSC3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms