Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM1Q6UX27 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms