Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms