Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRSAM1Q6UWE0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRSAM1Q6UWE0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms