Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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CSAG1Q6PB30 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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CSAG1Q6PB30 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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CSAG1Q6PB30 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CSAG1Q6PB30 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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CSAG1Q6PB30 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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CSAG1Q6PB30 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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CSAG1Q6PB30 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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CSAG1Q6PB30 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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CSAG1Q6PB30 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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CSAG1Q6PB30 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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CSAG1Q6PB30 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CSAG1Q6PB30 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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