Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SHEQ5VZ18 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHEQ5VZ18 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms