Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF3Q5VWG9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF3Q5VWG9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms