Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FOCADQ5VW36 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FOCADQ5VW36 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms