Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC183Q5T5S1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC183Q5T5S1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms