Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUP188Q5SRE5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUP188Q5SRE5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms