Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KLHL22Q53GT1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms