Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DUSP28Q4G0W2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUSP28Q4G0W2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms