Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SP6Q3SY56 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SP6Q3SY56 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms