Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STX1AQ16623 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STX1AQ16623 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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