Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAM1Q15629 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRAM1Q15629 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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