Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SF3A1Q15459 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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