Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHPRHQ149N8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHPRHQ149N8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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