Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GPNMBQ14956 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPNMBQ14956 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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