Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SSPNQ14714 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSPNQ14714 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms