Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARB2Q14108 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCARB2Q14108 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms