Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COL4A6Q14031 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL4A6Q14031 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms