Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLF9Q13886 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF9Q13886 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF9Q13886 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF9Q13886 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF9Q13886 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLF9Q13886 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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