Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KRR1Q13601 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KRR1Q13601 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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