Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSLNQ13421 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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