Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGADQ13349 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms