Protein–RNA interactions for Protein: Q13217

DNAJC3, DnaJ homolog subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC3Q13217 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
DNAJC3Q13217 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DNAJC3Q13217 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms