Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BNIP1Q12981 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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