Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF2Q12933 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF2Q12933 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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