Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LMAN2Q12907 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMAN2Q12907 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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