Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NFIAQ12857 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NFIAQ12857 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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