Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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RAB40BQ12829 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB40BQ12829 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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