Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBRQ0VD83 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBRQ0VD83 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms