Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
C2orf54Q08AI8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C2orf54Q08AI8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms