Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD300CQ08708 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD300CQ08708 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms