Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TYRO3Q06418 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TYRO3Q06418 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms