Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TOP2BQ02880 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms