Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NHLH2Q02577 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms