Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MS4A2Q01362 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.6 ms